Sempre al piano terra del Palazzo dei Musei, nel cortile coperto adiacente al quadriportico del Lapidario Estense, il Lapidario Romano dei Musei Civici espone una significativa selezione di monumenti recuperati nell'ultimo dopoguerra in città e nelle aree esterne al suo perimetro, dove si svilupparono in età imperiale le necropoli monumentali. Questi reperti lapidei testimoniano la ricchezza raggiunta dalla Modena romana.

In particolare, varie importanti attestazioni provengono da scavi nel settore est della via Emilia, la strada consolare; da qui giungono, ad esempio, la grandiosa ara funeraria del centurione Clodio e l'imponente  monumento della liberta di origine greca Vetilia Egloge, del I secolo d.C.: un'ara a più blocchi di pietra calcarea che, sovrapposti, raggiungono un'altezza di oltre quattro metri.